申报采取网上填报与纸质报送相结合的方式。
网上填报：企业通过专精特新中小企业在线报送系统，在线填写并上传相关材料。
提交纸质材料：企业通过网上填报后，提交纸质材料装订成册，一式三份，所有复印件加盖申报单位公章，并现场拷贝电子版。
完成在线申报后，企业填写并打印《2022年度山东省“专精特新”中小企业申请书》或《2022年度山东省“专精特新”中小企业复核申请书》，并参考“佐证材料”准备相关佐证材料，及时提交所在市中小企业主管部门。
各市初核推荐：各市中小企业主管部门按照申请书所列指标（7项必备指标和6项可选指标）进行初审核实，于5月20日前完成线上推荐，并于5月25日前将加盖公章的正式文件、推荐汇总表、企业申请书（以上均需纸质材料和电子版一式一份），邮政特快专递（EMS）至省工业和信息化厅创新创业指导处，佐证材料报送PDF版（原件扫描、每家企业1个文件）。
省级审核公布：省工业和信息化厅对各市推荐企业的材料进行复核，按照项目评审有关规定和工作规范组织专家评审。